1.煤炭開發戰略布局問題
近年來，我國東部地區煤炭產量基本維持穩定，甚至有所下降，中西部地區產量持續增長，其中產量內蒙古、寧夏、陜西和新疆增長較快。基于煤炭資源和水資源條件以及資源開發所面臨的多重約束和影響，新形勢下我國煤炭資源開發的戰略布局應該調整為“保護與減輕東部，穩定開發中部，加快開發西部”。
2.煤炭開發的總量控制問題
目前煤炭行業的疲軟與一定時期以來開發方式粗放、產能調控政策不科學緊密相關，也誤導了煤炭市場各類主體的行為。按照科學產能的概念，初步測算2010年我國煤炭資源科學產能約為10.78億噸，僅占全國煤炭總產量的33.3%。以科學產能為約束，在加強投入前提下，我國煤炭開發總量可控制在45億噸左右。
3.低品質煤的開發利用問題
我國低品質煤約占煤炭資源總量的40%左右，是我國不可或缺的煤炭資源，需要高度重視其開發利用。推進煤炭“全面提質、按質使用”，即以最簡單的方式、最少的投入、最有效的措施提高利用效率，減少無效運輸和污染物排放，是我國低品質煤炭利用的重要途徑。按照潔配度指標，即煤炭質量和滿足用煤設備煤質要求的程度，目前我國商品煤潔配度為25%，而美國高達60%。提升我國商品煤的潔配度，應逐步改善煤炭消費結構，提高煤炭質量，鼓勵對口消費。
4.輸煤輸電的協調發展問題
我國煤炭資源與區域經濟發展水平、煤炭消費需求的分布特點，決定了我國大規模“西煤東運，北煤南運”和“西電東送”的能源輸送格局。采用輸煤還是輸電實現大規模煤炭調運，主要比較論證輸送能效和成本。在現有經濟和技術水平條件下，輸煤輸電綜合平衡點在1800千米～2000千米左右，具體項目應結合關鍵制約因素，因地制宜論證，戰略上近距離宜選擇輸電、遠距離宜選擇輸煤。
5.燃燒與氣化的技術路線選擇問題
燃燒與氣化是重要的煤炭加工利用方式。煤炭燃燒主要應用在清潔高效發電和供熱領域，約占我國煤炭消費總量的80%。節能、高效、低污染是未來煤炭燃燒的基本要求，集約化、大容量、高參數是滿足這一要求的必然趨勢。從戰略角度看，煤氣化技術發展重點是大型化、高效率和環境友好，以大型先進煤氣化為核心的多聯產技術將成為高效清潔利用煤炭的重要方向。
6.先進燃煤發電的發展方向問題
近年來，隨著大型電力設備制造水平的快速提升以及上大壓小政策的落實，火電機組可靠性和效率顯著提高。我國以燃煤發電為主的電力格局，仍將是今后相當長時期內的發展重點。我國應因地制宜、統籌協調發展各類先進燃煤發電技術。
7.現代煤化工的有序發展問題
煤化工是我國煤炭利用的重要方向。我國傳統煤化工布局分散、技術水平較低、能耗較高、產能過剩、污染較嚴重，轉型勢在必行。我國已成功開發以煤制烯烴、煤制油、煤制甲烷、煤制乙二醇等為代表的現代煤化工先進工藝技術，并進行了工程示范。但是，各地從發展地方經濟的角度出發，盲目規劃和建設煤化工項目，已建、在建和規劃的煤化工項目的耗煤總量已達14億噸，大大超過發展預期。發展煤化工應統籌考慮各種化工產品的市場需求，結合煤、水等資源，合理規劃煤化工戰略布局，確保煤化工產業按照國家統一規劃有序發展。
8.煤基多聯產系統的發展方向問題
煤基多聯產是在現代煤化工和IGCC發電等單產技術發展的基礎上，通過有機耦合煤化工和聯合循環發電流程，實現電力、潔凈燃料和化工產品經濟、高效、清潔聯合生產。在環境污染嚴重、CO2排放壓力巨大、石油對外依存度高的客觀條件下，多聯產技術為煤炭高效、清潔、低碳及多用途利用提供了重要途徑，應作為我國煤炭利用的重點發展方向。
9.高耗能行業的節能問題
石化、鋼鐵、建材、化工、有色金屬、造紙和紡織是我國七大主要高能耗和高煤耗行業，2011年七大高耗能行業煤炭消費量占全國煤耗的34.9%。必須倡導節能為本的重要理念，更加注重應用端節能。我國高能耗行業和重點耗能企業面臨節能減排剛性目標提高的壓力，為保證節能目標的完成和行業可持續發展，必須大力實施節能重點工程。
10.污染物控制和碳減排問題
未來一段時期，我國煤炭消費量還將持續增長，傳統粗放的煤炭消費將帶來大量的污染物排放。按現有技術條件和污染物排放強度測算，2030年我國煤炭消費量必須控制在20億噸以下。但考慮經濟發展對能源的需求，預期2030年我國煤炭需求量將達到45億噸以上。解決這一尖銳矛盾的途徑在于技術進步，必須大幅度降低單位煤炭消費的污染物排放強度。如果考慮技術進步和強化管理帶來的排放強度降低，按照全國污染物排放控制目標測算，2020年和2030年滿足主要污染物排放量約束條件的最大煤炭消耗量分別為49.5億噸和50.5億噸。但是鑒于未來燃煤減排約束，以及環保要求進一步提高，我國最大允許煤炭消費量還應大幅降低，建議不超過38億噸。若突破該約束，應加強碳捕獲、利用與封存（CCUS）技術以及其他污染控制技術的開發和應用。
